Vuonna 2022 perustetun FC Halikon tukirahaston tarkoituksena on tukea taloudellisti seuran junioripelaajia jalkapallon ja futsalin kilpa- ja harrastustoiminnassa.
Tukihakemuksia vastaanotetaan pääsääntöisesti kaksi kertaa vuodessa ja hausta ilmoitetaan erikseen seuran junioreille ja heidän vanhemmilleen. Tukea myönnetään hakemusten perusteella ensisijaisesti heikossa taloudellisessa tilanteessa oleville pelaajille.
Rahaston johtoryhmä voi harkintansa mukaan tukea myös lahjakkaita pelaajia tai muuta yhteiskuntavastuullista toimintaa. FC Halikon johtokunta jakaa vuosittain rahaston varoista peruskoulun päättävän nuoren stipendin.